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abcam原裝抗體WB問(wèn)題超全總結詳解無(wú)信號,多條帶,高背景等難題 |靶點(diǎn)解惑

更新時(shí)間:2023-05-09      點(diǎn)擊次數:1699

蛋白免疫印跡(WB)是利用聚丙烯酰胺凝膠電泳來(lái)檢測特定樣品或提取物中某種特定蛋白的方法。聚丙烯酰胺凝膠緊貼著(zhù)膜放置,常用的膜是硝酸纖維素或PVDF(聚偏乙烯氟化物),在電流的作用下蛋白質(zhì)從凝膠遷移到膜上并且被固定。膜是凝膠蛋白質(zhì)的復制品,然后可以與抗體結合后進(jìn)行染色。免疫印跡(WB)是一項通過(guò)凝膠電泳按照分子量大小分離蛋白,然后再利用特異性抗體識別這些蛋白的技術(shù)。它是對蛋白進(jìn)行定性和相對定量的重要檢測工具。

您在WB實(shí)驗時(shí)是否遇到無(wú)信號、高背景、多帶等問(wèn)題?小編接下來(lái)將一一為您呈現這些問(wèn)題的常見(jiàn)原因和解決方案。

Chapter1



無(wú)信號常見(jiàn)原因和解決方案


WB實(shí)驗時(shí)出現無(wú)信號或信號弱現象,小艾歸納整理發(fā)現,主要是靶標自身特性和WB實(shí)驗流程中的樣本制備、轉膜、封閉、抗體孵育、洗膜和檢測等具體實(shí)驗細節問(wèn)題會(huì )導致這一現象。接下來(lái)小艾跟大家詳細扒一扒具體細節有哪些。

1.靶點(diǎn)特性導致無(wú)信號的常見(jiàn)原因及解決方案


▼ 組織或細胞中靶標蛋白含量低導致無(wú)信號或信號弱


可通過(guò)如下建議解決:


參考文獻或數據庫數據(例如The Human Protein Atlas)等,確認靶標蛋白是否在待檢組織或細胞中表達。我們總結了41個(gè)有表達特異性的熱門(mén)靶標表達信息,供大家參考(附錄1)。


增加上樣量,至少上樣20-30μg蛋白。


濃縮使信號大化(例如檢測核蛋白要用核裂解物;檢測膜蛋白用膜裂解液,超速離心分離膜蛋白)。我們總結了58個(gè)熱門(mén)靶標亞細胞定位信息,及其陽(yáng)性對照供大家參考(附錄2)。


參考文獻或產(chǎn)品說(shuō)明書(shū),誘導增加靶標蛋白表達。很多靶標蛋白需要藥物誘導或其它特殊處理,其含量才能達到WB檢測范圍,我們整理了17個(gè)熱門(mén)靶標蛋白在不同細胞系中藥物處理信息,及對應產(chǎn)品供大家參考(附錄3)。


選擇確認表達靶標蛋白的樣本作為陽(yáng)性對照(可參考產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)中提供的陽(yáng)性對照)。


附錄1 熱門(mén)靶標蛋白表達及陽(yáng)性對照

靶標名稱(chēng)

組織/細胞表達特異性(Uniprot)

Alpha-synuclein

•Alpha-synuclein主要在大腦中表達,在中樞神經(jīng)系統的突觸前末梢高度表達。

•在除肝臟外的組織中也有少量表達。

BDNF

•BDNF在海馬、杏仁核、大腦皮層和小腦等腦組織中高度表達。

•BDNF也表達于心臟、肺、骨骼肌、睪丸、前列腺和胎盤(pán)中。

Caspase-3 /cleaved Caspase-3

•在肺、脾、心臟、肝臟和腎臟中高度表達。

•腦和骨骼肌內中水平表達,睪丸低水平表達。

•在許多細胞系中表達,在免疫系統細胞中的表達最高。

?點(diǎn)擊此處查看更多熱門(mén)靶標組織/細胞表達特異性


附錄2 熱門(mén)靶標蛋白亞細胞定位及陽(yáng)性對照

靶標名稱(chēng)

蛋白亞細胞定位(Uniprot)

陽(yáng)性對照

Alpha-synuclein

細胞膜,細胞質(zhì),細胞核;也分泌于細胞連接、突觸和多巴胺能神經(jīng)元膜結合處。

•WB:HAP1、HEK293-T細胞裂解液 ;人、大鼠腦組織裂解液 ;重組人Alpha-synuclein蛋白(?ab51189 。

BDNF

分泌型

•WB:重組人/小鼠/大鼠BDNF蛋白(?ab9794) ;人,大鼠和小鼠的腦,海馬和小腦組織裂解液

BrdU

細胞核

•IHC:來(lái)自BrdU 處理的小鼠的未染色切片(?ab129956)。

 •ICC:BrdU處理的HeLa 細胞。



附錄3 熱門(mén)靶標蛋白陽(yáng)性對照及藥物處理條件


靶標名稱(chēng)

細胞系

試劑處理

產(chǎn)品

c-Fos

HeLa

血清饑餓36小時(shí),20% FBS(2小時(shí))

?ab214672

Jurkat

血清饑餓過(guò)夜,PMA(200 nM, 4 小時(shí))

RAW 264.7

血清饑餓過(guò)夜,PMA(200 nM, 4 小時(shí))

Cleaved Caspase-3

HAP1

星形孢菌素(2 μM, 24小時(shí))

?ab32042

HeLa

星形孢菌素(2 μM, 24小時(shí))

cleaved N-terminal DFNA5 / GSDME

SH-SY5Y

Etoposide(60 μM ,14小時(shí))

?ab222408

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▼組織或細胞中修飾后(磷酸化、乙?;头核鼗龋┑陌袠说鞍缀康?,可導致無(wú)信號或信號弱現象

可通過(guò)如下建議解決:


通常情況下,在未處理的組織或細胞中,大部分翻譯后修飾狀態(tài)下的蛋白含量較少。


參考文獻或產(chǎn)品說(shuō)明書(shū),誘導增加靶標蛋白含量。我們整理了25個(gè)熱門(mén)靶標,在不同細胞系中檢測其翻譯后修飾形式,需藥物處理條件及對應的產(chǎn)品,供大家參考(附錄3)。


裂解緩沖液中使用相應去修飾酶抑制劑。(例如靶蛋白磷酸化檢測,裂解液中需增加磷酸酶抑制劑)


陽(yáng)性對照(參考產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)中誘導試劑和條件,處理樣本。)


附錄3 翻譯后修飾靶標蛋白陽(yáng)性對照及藥物處理條件

靶標名稱(chēng)

細胞系

試劑處理

產(chǎn)品

eNOS(phospho S1177)

HUVEC

Pervanadate(100 uM,10分鐘)

?ab215717

JAK2(phospho Y1007 + Y1008)

Jurkat

Pervanadate(50 mM ,5分鐘)

?ab32101

C6 

Pervanadate(50 mM,5分鐘)

Hepa1-6

Pervanadate(100 µM,30分鐘)

MEF

Pervanadate(100 µM,30分鐘)

MLKL(phospho S345)

L-929

20 ng/ml TNF alpha,100 nM Smac mimetic和20 µM z-VAD(8小時(shí))

?ab196436

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注:具體細胞系處理信息請參考產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)


▼靶標蛋白是分泌型蛋白,檢測時(shí)分泌到細胞外,若檢測的樣本為全細胞裂解液,會(huì )出現無(wú)信號或信號弱現象

可通過(guò)如下建議解決:


使用 Brefeldin A(BFA)抑制蛋白分泌,提取全細胞裂解液。


如果全細胞裂解液中檢測不到靶蛋白,建議提取細胞培養上清中的蛋白。




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